Снова белка умудрилась своим орехом расколоть земной шар, что вызвало серьезные последствия для планеты Земля. Катаклизм застает врасплох Сида, Диего и Мэнни, ведь они оказались в открытом море, вдали от друзей. Пытаясь вернуться обратно, троица вынуждена отправиться в опаснейшее путешествие по морскому пространству, в волнах которого скрываются экзотические существа морского мира, а между льдинами шныряют пираты, отыскивая очередную жертву. Но что же стало с виновницей этих событий? Доисторическая белка должна отправиться в далекие районы, где еще не ступала её лапа и всё это ради воссоединения с орехом.